Az Nemzeti Fejlesztési Ügynökség az első pályázatok kiírása során szerzett tapasztalatok alapján módosította az uniós támogatások felhasználását. A főbb módosítások az ügynökség honlapján olvashatóak. Új szabály, hogy az elbírálás után az elutasított pályázatok is megjelennek a honlapon, a projekt adatlapokat és az előrehaladási jelentéseket ezentúl pedig elektronikusan kell benyújtani. A korrupció visszaszorítása érdekében közzéteszik az ajánlatok elbírálásakor készített összegezéseket is. A rendelet alkalmazóinak azonban elengedhetetlen a módosított szöveg ismerete.