Az operatív programok benyújtása után három-négy hónapos feldolgozásra lehet számítani. Azokban a témákban, amelyekben egyetértés van az Európai Unióval, az operatív programok jóváhagyása előtt pályázati kiírások jelennek meg. Várhatóan január végén a 2007. utáni fejlesztési forrásokra pályázatokat írnak ki a kisvállalkozások támogatására, munkahelyteremtésre, a foglalkoztatás ösztönzésére az ideiglenes akciótervek alapján.
Az új pályázati rendszer egyszerűbb, gyorsabb, átláthatóbb és érthetőbb lesz. Ennek jegyében kevesebb igazolást kérnek be, az állami igazolások beszerzése pedig a pályáztató feladata lesz. Egységesítik az eljárási rendet, bevezetik az egyablakos ügyintézést. A tervek szerint jövőre teljes körű elektronikus ügyintézést, egyszerűbb és gyorsabb kifizetési eljárást vezetnek be.
Könnyítés várható a garanciák területén, többi között az önkormányzatoktól, civil szervezetektől, egyházaktól nem kérnek pénzügyi garanciát, a gazdálkodó szervezetek pedig a projekt megvalósítás utáni szakaszában csökkentett mértékű garanciát fizetnek.