A GKM 100 millió forintos, az NKTH 300 millió forintos hozzájárulásával, az NKTH szervezésében, az OTKA által már korábban kidolgozott feltételek alapján, 2006-ban 400 millió forint keretösszeggel közös pályázatot hirdetnek fiatal tudósjelöltek, posztdoktorok számára. Az Országházban tartott tájékoztatón bejelentett összeggel kapcsolatban a Kóka János miniszter megjegyezte, hogy korábban fiatal kutatói pályázatokra az OTKÁ-ban összesen 60 millió forint forrás állt volna rendelkezésre.
A megállapodás második pontja szerint az MTA kész az OTKA tematikus pályázati céljaira 300 millió forintot a saját költségvetésén belül átcsoportosítani.
Kóka János jónak értékelte az MTA vezetőjével történő együttműködést, bejelentette: 2006-ban az európai uniós forrásokból megmaradt részek terhére a kutatás-fejlesztésre 3 milliárd forintot különítenek el
