A pályázat kiírói évente 250-400 pályázatra számítanak; ebből körülbelül 55-80 részesülhet támogatásban. A pályázat három éves időtartama alatt összesen 6 milliárd forintot nyerhetnek el a pályázók. A 2008-as pályázati forduló tervezett keretösszege 2 milliárd forint. A pályázat forrása a vállalatok által befizetett innovációs járulékból gazdálkodó Innovációs Alap.

Az NKTH közleménye szerint az OTKA és az NKTH együttműködésének keretében a 2008-2010 közötti időszakra hirdetik meg a "Gazdaságban hasznosuló innovációt megalapozó alapkutatás támogatása" című pályázatot, amelynek célja gazdasági vagy társadalmi hasznú célzott alapkutatási projektek támogatása.

A kiírás a műszaki- és természettudományokkal, valamint az élettudományokkal foglalkozó kutatóműhelyeknek szól. A pályázatot két kategóriában lehet benyújtani. Az első, "célzott alapkutatás" kategóriában egy kutató és az őt foglalkoztató intézmény közösen nyújthat be alapkutatási projektjavaslatot, 10 és 50 millió forint közötti támogatásra.

A "kiemelt célzott alapkutatások" kategóriában kiemelkedő kutató által vezetett nagy kutatócsoportok vagy kutatócsoportok együttműködésében (konzorciális pályázat) végzett, kiemelt kutatások támogathatók. A kiemelt kutatás épülhet például a tudományos iskolákban dolgozó fiatal kutatókra, vagy jelenthet például olyan nagy jelentőségű, új kutatást, amely jelentős anyag- illetve műszerbeszerzést igényel. Ebben a kategóriában a támogatás maximális összege 150 millió forint.

A pályázatok futamideje az első kategória esetében 2-3, a másodikban 3 év. A pályázati kiírás mindkét kategória esetében nagy hangsúlyt fektet arra, hogy a támogatott kutatásokban lehetőség szerint doktorandusz hallgatók is helyet kaphassanak.