A 2012 első napján hatályba lépett együttműködési megállapodás keretében a két szervezet vállalja, hogy saját eszközeivel elősegíti a környezethasználók és a környezet védelme érdekében működő szervezetek jogkövető magatartását, a környezetvédelmi jogszabályok betartását. Megállapodnak abban is, hogy céljaikat egyrészt jogi, hatósági eszközökkel, másrészt szakmai tevékenységgel, egymást erősítve a végzik és a kitűzött cél érdekében rendszeresen egyeztetnek.
Az egységes hatósági jogalkalmazás érdekében a felek különös figyelmet kívánnak szentelni a hatósági, jogalkalmazási gyakorlatban jelentkező nehézségek tisztázásának, valamint az egyes hulladékkezeléssel foglalkozó szervezetekre vonatkozó ellenőrzési protokollok kidolgozásának. (Havi 150 forinttal drágul a szemét elszállítása, mert az EU elvárása, hogy minél kevesebb háztartási hulladék kerüljön lerakóba.) Emellett kiemelt cél a rendszeres konzultációs formák kialakítása és fenntartása, valamint az egyes szakmai képzéseken, konferenciákon való kölcsönös részvétel, szakmai anyagok, kiadványok cseréje.
A megállapodás arra is lehetőséget ad, hogy környezetvédelmi tárgyú jogszabályok tervezetének véleményezése során a felek konzultáljanak, vagy kiemelt jelentőségű ügyek esetén közös eseti munkacsoportot is létre hozhatnak a feladat végrehajtása céljából.
A NAV és a KSZGYSZ között létrejövő megállapodás példaértékű abban a tekintetben, hogy lehetővé teszi a hatóság és a szakmai szervezetek közös célért való együttműködését, a problémákról való közös gondolkodást, a szakmai ismeretanyagok kölcsönös bővítését, de nem utolsó sorban a kölcsönös bizalom kiépülését.