A 35 fejezet tárgyalását a legegyszerűbbel kezdték: a tudomány és kutatás című fejezetben ugyanis alig van mit vizsgálni.
A török csatlakozási tárgyalások megkezdéséről szóló vita a külügyminiszterek tanácsában folytatódott, miután Ciprus a pénteki nagyköveti találkozón (2006. június 9.) megvétózta a hétfői tárgyaláskezdést. Ciprus politikai engedményeket követelt Ankarától, mielőtt a fejezet lezárásra kerülne. A ciprusiak országuk elismerésére és az Ankarai megállapodás betartására próbálták rávenni Törökországot.
Ciprus végül azt követően állt el a blokkolástól, hogy a külügyminiszterek megerősítették a tárgyalási folyamatnak azt az alapelvét, miszerint egyetlen fejezet sem tekinthető véglegesen lezártnak mindaddig, amíg a tárgyalások tartanak.