A kiemelt és a legnagyobb adóteljesítményű adózók ellenőrzési szempontjai nem változtak: a központban a különböző adókedvezmények (fejlesztési, energiahatékonysági célú beruházási felújítási), a társasági adóalapot növelő és csökkentő tételek, valamint a transzferárak vizsgálata, illetve a kapcsolt vállalkozások között alkalmazott árak kontrollja állnak. A transzferár-adatszolgáltatás adatai alapján kockázatos ügyleteket bonyolító, valamint a veszteséges, vagy igen alacsony nyereséget elérő korlátozott kockázatú (rutin) gyártási, forgalmazási vagy szolgáltatási tevékenységet végző adózók transzferár szempontú ellenőrzése kiemelt cél.
A NAV továbbra is kiemelt figyelmet fordít az áfacsalások feltárására, megszüntetésére, és az esetleges új csalási mechanizmusok kiszűrésére. Továbbra is fókuszban marad az online adatszolgáltatások és áfabevallások, valamint a biztosítotti bejelentések és a járulékbevallások egyezősége. Az egyéni vállalkozóknál a hivatal elemzi a folyamatosan érkező adatokat és bevallásokat, több adónemet érintően is, így ellenőrzésre számíthatnak azok, akiknél eltérést tapasztal.
A vámellenőrzések 2025-ben is a vámérték valódiságának megállapítására, az importnál jelentkező alulértékelések feltárására, valamint a közösségi és belföldi forgalomban tetten érhető áfakikerülés felszámolására irányulnak. Továbbra is előtérben van az EU-ból és a harmadik országból behozott, és itt forgalomba helyezett új gépjárművek utáni regisztrációsadó- és áfafizetés ellenőrzése. Folytatódik a csempészáruk illegális forgalmának visszaszorítása, valamint a hazai és nemzetközi jogszabályokban meghatározott korlátozások, tilalmak következetes érvényesítése, szankciós rendelkezések betartatása. A rendészeti terület komplex tevékenységével járul hozzá a költségvetési bevételeinek növeléséhez.