A World Wildlife Fund UK becslései szerint a legnagyobb bajban a jávai orrszarvúak vannak, már csak körülbelül 75 példány maradt a vadonban. Miután megtalálták az indiai szubkontinens keleti széle között egészen Indonéziáig, számukat folyamatosan csökkentette a vadászat és az emberi települések növekedése. Most már csak az Ujung Kulon Nemzeti Parkban találhatók Jávában, Indonéziában.
Indonézia esőerdői a madarak 17 százalékának, a világ emlőseinek 12 százalékának és az összes növény 10 százalékának adnak otthont, de számuk folyamatosan csökken, ahogy az ország népessége növekszik.
Ennek következményeként az államban már sok faj kihalt. Jelenleg négy Indonéziában élő állat szerepel a WWF legveszélyeztetettebbeket dokumentáló 10-es listáján.
A jávai orrszarvún kívül ide tartozik: a Szunda-szigeti tigris, valamint a tapanuli és szumátrai orangutánok.
A Szunda-szigeti tigris az összes tigrisfaj közül a legkisebb. Jávai és balinéz társait a vadászat és az élőhelyek elvesztése már a kipusztulás felé sodorta. Ázsiában három nagy majomfaj él, ezek közül kettő a tapanuli és szumátrai orangutánok.